10 июня 2009 года в Санкт-Петербурге в суд было передано уголовное дело об убийстве студента Дениса Едзаускиса. 22-летнему Владимиру Соснихину инкриминируется п. "и" ч. 2 ст. 105 (убийство из хулиганских побуждений). и ч. 2 ст. 213 (хулиганство, совершенное группой лиц по предварительному сговору).

В ночь на 7 июня 2009 года в Москве на станции метро "Чистые пруды" группа пьяных мужчин развязала конфликт с уроженцем Чечни и дагестанцем. Один из последних в ходе конфликта применил травматическое оружие. По словам стрелявшего Тимура Мадаева, группа приставших мужчин была примерно из восьми человек. Они были агрессивно настроены, стали называть Мадаева и его спутника "чурками" .

8 июня в Карачаево-Черкесии по инициативе общественных организаций и Духовного управления мусульман республики было принято решение о создании "Дома дружбы". Он учреждается с целью укрепления межнациональных и межрелигиозных отношений в Карачаево-Черкесии. Заместитель ДУМ КЧР Исмаил Бостанов предложил объединить усилия общественных организаций и духовенства в деле духовного воспитания граждан республики. "Чтобы у нас выросла достойная молодежь, нужно начинать с воспитания родителей.

10 июня 2009 года в Славянском правовом центре состоялась пресс-конференция "Инквизиторам - нет!": мы за светское государство в России". На ней были подведены первые итоги Общероссийской бессрочной акции "Инквизиторам - нет!" , которая стартовала 22 апреля. В пресс-конференции приняли участие представители научного сообщества и общественных организаций, а также верующие различных конфессий.

15 мая в Белгороде от пожара пострадал от пожара РПЦ в честь святых Веры, Надежды, Любови и Софии. 29 мая пресс-служба губернатора сообщила о 380 тыс. рублей пожертвований, внесённых на расчетный счёт местной епархии РПЦ. Из них 7 800 рублей составили взносы частных лиц, остальные поступления обеспечили субъекты хозяйственной деятельности. 9 июня стало известно о том, что сумма перечислений для восстановления церкви составила 2 383 336 рублей.

9 июня 2009 года в Санкт-Петербурге было возбуждено уголовное дело по ст. 282 УК РФ (возбуждение ненависти либо вражды) по факту обнаружения экстремистской литературы в молельной комнате на Сенном рынке.

10 июня 2009 года стало известно, что в Москве сотрудниками ФСБ и МВД задержан неонацист, подозреваемый в подготовке крупного теракта, планировавшегося в столице на 5 мая . По версии правоохранительных органов, 5 мая в людном месте Москвы праворадикалами был запланирован теракт. "Задержанным является 16-летний житель Люблино, который в домашних условиях изготовил восьмикилограммовое взрывное устройство.

На конференции, посвященной теме отношений религии и государства, состоявшейся в Москве в июне, замначальника управления воспитательной работы Сухопутных войск РФ полковник Петр Брянцев заявил, что за последние 12 лет количество военнослужащих (всех родов войск), относящих себя к последователям какой-либо религии, увеличилось до 63%.

9 июня стало известно о том, что Уралсвязьинформ (УСИ) направил иски о взыскании задолженности к религиозным институтам. Один из исков поступил к Екатеринбургской епархии РПЦ. Речь идёт о двух объектах РПЦ - Храме на Крови во имя Всех святых в Земле российской просиявших и Патриаршем подворье. УСИ требует взыскать с РПЦ 215 466 рублей 23 копейки. Кроме того, Нижнетагильский территориальный узел электросвязи УСИ направил иск в отношении местной мусульманской религиозной организации "Махалля".